論文 - 古谷　祐詞

SNap bond, a crucial hydrogen bond between Ser in helix 3 and Asn in helix 4, regulates the structural dynamics of heliorhodopsin 査読あり

Toshiki Nakamura, Manish Singh, Masahiro Sugiura, Soichiro Kato, Ryo Yamamoto, Hideki Kandori, and Yuji Furutani*

J. Mol. Biol.   436 ( 16 )   168666   2024年08月

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担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jmb.2024.168666

The high-light-sensitivity mechanism and optogenetic properties of the bacteriorhodopsin-like channelrhodopsin GtCCR4 査読あり 国際共著

Tatsuki Tanaka, Shoko Hososhima, Yo Yamashita, Teppei Sugimoto, Toshiki Nakamura, Shunta Shigemura, Wataru Iida, Fumiya K. Sano1, Kazumasa Oda, Takayuki Uchihashi, Kota Katayama, Yuji Furutani, Satoshi P. Tsunoda, Wataru Shihoya*, Hideki Kandori*, Osamu Nureki*

Mol. Cell   84 ( 18 )   3530 - 3544   2024年09月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.molcel.2024.08.016

Experimental and computational biophysics to identify vasodilator drugs targeted at TRPV2 using agonists based on the probenecid scaffold 査読あり 国際共著

Èric Catalina-Hernández, Mario López-Martín, David Masnou-Sánchez, Marco Martins, Víctor A. Lórenz-Fonfría, Francesc Jiménez-Altayó, Ute A. Hellmich, Hitoshi Inada, Antonio Alcaraz, Yuji Furutani, Alfons Nonell-Canals, Jose Luis Vázquez-Ibar, Carmen Domene, Rachelle Gaudet, and Alex Perálvarez-Marín*

Comput. Struct. Biotechnol. J.   23   473 - 482   2023年12月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.csbj.2023.12.028

Internal Proton Transfer in the Activation of Heliorhodopsin 招待あり 査読あり

Manish Singh, Masanori Hashimoto, Kota Katayama, Yuji Furutani, and Hideki Kandori

J. Mol. Biol.   2023年09月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.jmb.2023.168273

Concerted primary proton transfer reactions in a thermophilic rhodopsin studied by time-resolved infrared spectroscopy at high temperature 査読あり

Kunisato Kuroi, Takashi Tsukamoto, Naoya Honda, Yuki Sudo, and Yuji Furutani

Biochim. Biophys. Acta – Bioenergetics   1864 ( 3 )   148980   2023年08月

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担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.bbabio.2023.148980

Protonation of Asp116 and distortion of an all-trans retinal chromophore in Krokinobacter eikastus rhodopsin 2 causes a redshift in absorption maximum upon dehydration 査読あり

Sahoko Tomida, Akimori Wada and Yuji Furutani

Photochem. Photobiol. Sci.   22 ( 11 )   2499 - 2517   2023年07月

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担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1007/s43630-023-00464-8

High-speed scanless entire bandwidth mid-infrared chemical imaging 査読あり 国際共著

Yue Zhao, Shota Kusama, Yuji Furutani, Wei-Hong Huang, Chih-Wei Luo, and Takao Fuji

Nat. Commun.   14   3929   2023年07月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/s41467-023-39628-6

Covalent Bond between Lys-255 Residue and the Main Chain is Responsible for Stable Retinal Chromophore Binding and Sodium-Pumping Activity of Krokinobacter Rhodopsin 2 査読あり 国際共著

Shoha Ochiai, Yuki Ichikawa, Sahoko Tomida, and Yuji Furutani

Biochemistry   62 ( 12 )   1849 - 1857   2023年06月

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担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/acs.biochem.3c00168

Specific Zinc Binding to Heliorhodopsin 査読あり

Masanori Hashimoto, Koichi Miyagawa, Manish Singh, Kota Katayama, Mitsuo Shoji, Yuji Furutani, Yasuteru Shigeta, and Hideki Kandori

Phys. Chem. Chem. Phys.   25 ( 4 )   3535 - 3543   2023年01月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1039/d2cp04718g

Unusual Photoisomerization Pathway in a Near-Infrared Light Absorbing Enzymerhodopsin 査読あり 国際共著

Masahiro Sugiura, Kazuki Ishikawa, Kota Katayama, Yuji Sumii, Rei Abe-Yoshizumi, Satoshi Tsunoda, Yuji Furutani, Norio Shibata, Leonid Brown, and Hideki Kandori*

The Journal of Physical Chemistry Letters   13   9539 - 9543   2022年10月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/acs.jpclett.2c02334

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpclett.2c02334

Rhodopsin-bestrophin fusion proteins from unicellular algae form gigantic pentameric ion channels 査読あり 国際共著

Andrey Rozenberg, Igor Kaczmarczyk, Donna Matzov, Johannes Vierock, Takashi Nagata, Masahiro Sugiura, Kota Katayama, Yuma Kawasaki, Masae Konno, Yujiro Nagasaka, Mako Aoyama, Ishita Das, Efrat Pahima, Jonathan Church, Suliman Adam, Veniamin A. Borin, Ariel Chazan, Sandra Augustin, Jonas Wietek, Julien Dine, Yoav Peleg, Akira Kawanabe, Yuichiro Fujiwara, Ofer Yizhar, Mordechai Sheves, Igor Schapiro, Yuji Furutani, Hideki Kandori, Keiichi Inoue, Peter Hegemann, Oded Béjà*, Moran Shalev-Benami*

nature structural & molecular biology   29   592 - 603   2022年06月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/s41594-022-00783-x

その他リンク： https://www.nature.com/articles/s41594-022-00783-x

Desiccation-induced fibrous condensation of CAHS protein from an anhydrobiotic tardigrade 査読あり 国際誌

Maho Yagi-Utsumi, Kazuhiro Aoki, Hiroki Watanabe, Chihong Song, Seiji Nishimura, Tadashi Satoh, Saeko Yanaka, Christian Ganser, Sae Tanaka, Vincent Schnapka, Ean Wai Goh, Yuji Furutani, Kazuyoshi Murata, Takayuki Uchihashi, Kazuharu Arakawa, Koichi Kato

Scientific Reports   11   21328   2021年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/s41598-021-00724-6

その他リンク： https://www.nature.com/articles/s41598-021-00724-6

Inverse Hydrogen-Bonding Change Between the Protonated Retinal Schiff Base and Water Molecules upon Photoisomerization in Heliorhodopsin 48C12 査読あり 国際誌

Sahoko Tomida, Shinya Kitagawa, Hideki Kandori, Yuji Furutani

The Journal of Physical Chemistry B   125 ( 30 )   8331 - 8341   2021年07月

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担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/acs.jpcb.1c01907

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.1c01907

Zinc Binding to Heliorhodopsin 査読あり 国際誌

Masanori Hashimoto, Kota Katayama, Yuji Furutani, and Hideki Kandori

The Journal of Physical Chemistry Letters   11 ( 20 )   8604 - 8609   2020年10月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/acs.jpclett.0c02383

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpclett.0c02383

Infrared spectroscopic analysis on structural changes around the protonated Schiff base upon retinal isomerization in light-driven sodium pump KR2 査読あり 国際誌

Sahoko Tomida, Shota Ito, Tomoya Mato, Yuji Furutani, Keiichi Inoue, and Hideki Kandori

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics   1861 ( 7 )   148190   2020年07月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier B.V.  

DOI： 10.1016/j.bbabio.2020.148190

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0005272820300402

Mechanism of Inward Proton Transport in an Antarctic Microbial Rhodopsin 査読あり 国際共著 国際誌

Andrew Harris, Michalis Lazaratos, Malte Siemers, Ethan Watt, Anh Hoang, Sahoko Tomida, Luiz Schubert, Mattia Saita, Joachim Heberle, Yuji Furutani, Hideki Kandori, Ana-Nicoleta Bondar, and Leonid Brown

The Journal of Physical Chemistry B   124 ( 24 )   4851 - 4872   2020年06月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/acs.jpcb.0c02767

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.0c02767

Regulation of Photocycle Kinetics of Photoactive Yellow Protein by Modulating Flexibility of β-Turn 査読あり 国際誌

Yasushi Imamoto, Hiroaki Sasayama, Miki Harigai, Yuji Furutani, & Mikio Kataoka

The Journal of Physical Chemistry B   124 ( 8 )   1452 - 1459   2020年02月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/acs.jpcb.9b11879

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.9b11879

Crystal structure of heliorhodopsin 査読あり 国際共著 国際誌

Wataru Shihoya, Keiichi Inoue, Manish Singh, Masae Konno, Shoko Hososhima, Keitaro Yamashita, Kento Ikeda, Akimitsu Higuchi, Tamaki Izume, Sae Okazaki, Masanori Hashimoto, Ritsu Mizutori, Sahoko Tomida, Yumeka Yamauchi, Rei Abe-Yoshizumi, Kota Katayama, Satoshi P. Tsunoda, Mikihiro Shibata, Yuji Furutani, Alina Pushkarev, Oded Béjà, Takayuki Uchihashi, Hideki Kandori, Osamu Nureki

Nature   574   132 - 136   2019年09月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Springer Nature  

DOI： 10.1038/s41586-019-1604-6

その他リンク： https://www.nature.com/articles/s41586-019-1604-6

Vibrational and Molecular Properties of Mg2+ Binding and Ion Selectivity in the Magnesium Channel MgtE 査読あり 国際共著 国際誌

Tetsunari Kimura, Victor A. Lorenz-Fonfria, Shintaro Douki, Hideyoshi Motoki, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki, Masahiro Higashi, Yuji Furutani

The Journal of Physical Chemistry B   122 ( 42 )   9681 - 9696   2018年09月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/acs.jpcb.8b07967

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.8b07967

Structural properties determining low K⁺ affinity of the selectivity filter in the TWIK1 K⁺ channel. 査読あり 国際誌

Hisao Tsukamoto, Masahiro Higashi, Hideyoshi Motoki, Hiroki Watanabe, Christian Ganser, Koichi Nakajo, Yoshihiro Kubo, Takayuki Uchihashi, Yuji Furutani

The Journal of Biological Chemistry   293 ( 18 )   6969 - 6984   2018年05月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (ASBMB)  

DOI： 10.1074/jbc.RA118.001817

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925820410725

PDMS-Based Microfluidic Device for Infrared-Transmission Spectro-electrochemistry 査読あり 国際共著 国際誌

Akkapol Suea-Ngam, Monpichar Srisa-Art, Yuji Furutani

Bulletin of the Chemical Society of Japan   91 ( 5 )   728 - 734   2018年02月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：The Chemical Society of Japan  

DOI： 10.1246/bcsj.20170430

その他リンク： https://www.journal.csj.jp/doi/10.1246/bcsj.20170430

"In situ" observation of the role of chloride ion binding to monkey green sensitive visual pigment by ATR-FTIR spectroscopy. 査読あり 国際誌

Kota Katayama, Yuji Furutani, Masayo Iwaki, Tetsuya Fukuda, Hiroo Imai, Hideki Kandori

Physical Chemistry Chemical Physics   20 ( 5 )   3381 - 3387   2017年12月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Royal Societry of Chemistry  

DOI： 10.1039/c7cp07277e

PubMed

その他リンク： https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2018/CP/C7CP07277E

The Impact of the Polymer Chain Length on the Catalytic Activity of Poly(N-vinyl-2-pyrrolidone)-supported Gold Nanoclusters. 査読あり 国際誌

Setsiri Haesuwannakij, Tetsunari Kimura, Yuji Furutani, Kazu Okumura, Ken Kokubo, Takao Sakata, Hidehiro Yasuda, Yumi Yakiyama, Hidehiro Sakurai

Scientific Reports   7 ( 1 )   9579   2017年08月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Nature Publishing Group  

DOI： 10.1038/s41598-017-10165-9

PubMed

その他リンク： https://www.nature.com/articles/s41598-017-10165-9

A ciliary opsin in the brain of a marine annelid zooplankton is ultraviolet-sensitive, and the sensitivity is tuned by a single amino acid residue 査読あり 国際誌

Hisao Tsukamoto, I-Shan Chen, Yoshihiro Kubo, Yuji Furutani

Journal of Biological Chemistry   292 ( 31 )   12971 - 12980   2017年08月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (ASBMB)  

DOI： 10.1074/jbc.M117.793539

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925820400675

Structural insights into the nucleotide base specificity of P2X receptors 査読あり 国際誌

Go Kasuya, Yuichiro Fujiwara, Hisao Tsukamoto, Satoshi Morinaga, Satoshi Ryu, Kazushige Touhara, Ryuichiro Ishitani, Yuji Furutani, Motoyuki Hattori, Osamu Nureki

Scientific Reports   7   45208   2017年03月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Nature Publishing Group  

DOI： 10.1038/srep45208

PubMed

その他リンク： https://www.nature.com/articles/srep45208

Live-cell single-molecule imaging of the cytokine receptor MPL for analysis of dynamic dimerization 査読あり 国際誌

Akihiko Sakamoto, Takashi Tsukamoto, Yuji Furutani, Yuki Sudo, Kazuyuki Shimada, Akihiro Tomita, Hitoshi Kiyoi, Takashi Kato, Takashi Funatsu

Journal of Molecular Cell Biology   8 ( 6 )   553 - 555   2016年12月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Oxford University Press  

DOI： 10.1093/jmcb/mjw027

PubMed

その他リンク： https://academic.oup.com/jmcb/article/8/6/553/2647067

Simple and rapid fabrication of PDMS microfluidic devices compatible with FTIR microspectroscopy 査読あり 国際共著 国際誌

Monpichar Srisa-Art, Yuji Furutani

Bulletin of the Chemical Society of Japan   89 ( 2 )   195 - 202   2015年11月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：The Chemical Society of Japan  

DOI： 10.1246/bcsj.20150357

その他リンク： https://www.journal.csj.jp/doi/10.1246/bcsj.20150357

Retinal attachment instability is diversified among mammalian melanopsins 査読あり 国際共著 国際誌

Hisao Tsukamoto, Yoshihiro Kubo, David L. Farrens, Mitsumasa Koyanagi, Akihisa Terakita, Yuji Furutani

Journal of Biological Chemistry   290 ( 45 )   27176 - 27187   2015年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (ASBMB)  

DOI： 10.1074/jbc.M115.666305

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925820494840

Specific interactions between alkali metal cations and the KcsA channel studied using ATR-FTIR spectroscopy. 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Hirofumi Shimizu, Yusuke Asai, Shigetoshi Oiki, Hideki Kandori

Biophysics and Physicobiology   12   37 - 45   2015年09月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：The Biophysical Society of Japan  

DOI： 10.2142/biophysico.12.0_37

PubMed

その他リンク： https://www.jstage.jst.go.jp/article/biophysico/12/0/12_37/_article

New insights into metal ion-crown ether complexes revealed by SEIRA spectroscopy 査読あり 国際誌

Yoshiya Inokuchi, Takayuki Ebata, Toshiaki Ikeda, Takeharu Haino, Tetsunari Kimura, Hao Guo, Yuji Furutani

New Journal of Chemistry   39 ( 11 )   8673 - 8680   2015年08月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Royal Societry of Chemistry  

DOI： 10.1039/c5nj01787d

その他リンク： https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2015/nj/c5nj01787d

Chimeras of channelrhodopsin-1 and-2 from chlamydomonas reinhardtii exhibit distinctive light-induced structural changes from channelrhodopsin-2 査読あり 国際誌

Asumi Inaguma, Hisao Tsukamoto, Hideaki E. Kato, Tetsunari Kimura, Toru Ishizuka, Satomi Oishi, Hiromu Yawo, Osamu Nureki, Yuji Furutani

Journal of Biological Chemistry   290 ( 18 )   11623 - 11634   2015年05月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (ASBMB)  

DOI： 10.1074/jbc.M115.642256

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925820570002

Attenuated total reflectance spectroscopy with chirped-pulse upconversion 査読あり 国際誌

Hideto Shirai, Constance Duchesne, Yuji Furutani, Takao Fuji

Optics Express   22 ( 24 )   29611 - 29616   2014年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：The Optical Society (OSA)  

DOI： 10.1364/OE.22.029611

PubMed

その他リンク： https://www.osapublishing.org/oe/fulltext.cfm?uri=oe-22-24-29611&id=304803

Distribution of mammalian-like melanopsin in cyclostome retinas exhibiting a different extent of visual functions 査読あり 国際誌

Lanfang Sun, Emi Kawano-Yamashita, Takashi Nagata, Hisao Tsukamoto, Yuji Furutani, Mitsumasa Koyanagi, Akihisa Terakita

PLoS ONE   9 ( 9 )   e108209   2014年09月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Public Library of Science  

DOI： 10.1371/journal.pone.0108209

PubMed

その他リンク： https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0108209

His166 Is the Schiff Base Proton Acceptor in Attractant Phototaxis Receptor Sensory Rhodopsin I 査読あり 国際共著 国際誌

Jun Sasaki, Hazuki Takahashi, Yuji Furutani, Oleg A. Sineshchekov, John L. Spudich, Hideki Kandori

Biochemistry   53 ( 37 )   5923 - 5929   2014年08月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi500831n

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi500831n

Self-assembly of the chaperonin GroEL nanocage induced at submicellar detergent 査読あり 国際共著 国際誌

Jin Chen, Hisashi Yagi, Yuji Furutani, Takashi Nakamura, Asumi Inaguma, Hao Guo, Yan Kong, Yuji Goto

Scientific Reports   4   5614   2014年07月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Nature Publishing Group  

DOI： 10.1038/srep05614

PubMed

その他リンク： https://www.nature.com/articles/srep05614

Formation of host-guest complexes on gold surface investigated by surface-enhanced IR absorption spectroscopy 査読あり 国際誌

Yoshiya Inokuchi, Takahiro Mizuuchi, Takayuki Ebata, Toshiaki Ikeda, Takeharu Haino, Tetsunari Kimura, Hao Guo, Yuji Furutani

Chemical Physics Letters   592   90 - 95   2014年01月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier B.V.  

DOI： 10.1016/j.cplett.2013.12.026

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0009261413015078

Development of a rapid Buffer-exchange system for time-resolved ATR-FTIR spectroscopy with the step-scan mode 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Tetsunari Kimura, Kido Okamoto

Biophysics (Japan)   9   123 - 129   2013年08月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：The Biophysical Society of Japan  

DOI： 10.2142/biophysics.9.123

PubMed

その他リンク： https://www.jstage.jst.go.jp/article/biophysics/9/0/9_123/_article

Distortion of the amide-I and -II bands of an α-helical membrane protein, pharaonis halorhodopsin, depends on thickness of gold films utilized for surface-enhanced infrared absorption spectroscopy 査読あり 国際誌

Hao Guo, Tetsunari Kimura, Yuji Furutani

Chemical Physics   419   8 - 16   2013年06月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier B.V.  

DOI： 10.1016/j.chemphys.2012.11.011

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0301010412004399

Large spectral change due to amide modes of a β-sheet upon the formation of an early photointermediate of middle rhodopsin 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Takashi Okitsu, Louisa Reissig, Misao Mizuno, Michio Homma, Akimori Wada, Yasuhisa Mizutani, Yuki Sudo

The Journal of Physical Chemistry B   117 ( 13 )   3449 - 3458   2013年03月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/jp308765t

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jp308765t

ATR-FTIR spectroscopy revealing the different vibrational modes of the selectivity filter interacting with K⁺ and Na⁺ in the open and collapsed conformations of the KcsA potassium channel 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Hirofumi Shimizu, Yusuke Asai, Tetsuya Fukuda, Shigetoshi Oiki, Hideki Kandori

The Journal of Physical Chemistry Letters   3 ( 24 )   3806 - 3810   2012年12月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/jz301721f

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jz301721f

Dynamics of dangling bonds of water molecules in pharaonis halorhodopsin during chloride ion transportation 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Kuniyo Fujiwara, Tetsunari Kimura, Takashi Kikukawa, Makoto Demura, Hideki Kandori

The Journal of Physical Chemistry Letters   3 ( 20 )   2964 - 2969   2012年09月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/jz301287n

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jz301287n

Comparative FTIR study of a new fungal rhodopsin 査読あり 国際共著 国際誌

Hiroyasu Ito, Masayo Sumii, Akira Kawanabe, Ying Fan, Yuji Furutani, Leonid S. Brown, Hideki Kandori

The Journal of Physical Chemistry B   116 ( 39 )   11881 - 11889   2012年09月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/jp306993a

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jp306993a

Protein-bound water molecules in primate red- and green-sensitive visual pigments 査読あり 国際誌

Kota Katayama, Yuji Furutani, Hiroo Imai, Hideki Kandori

Biochemistry   51 ( 6 )   1126 - 1133   2012年01月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi201676y

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi201676y

Sensory rhodopsin-I as a bidirectional switch: Opposite conformational changes from the same photoisomerization 査読あり 国際誌

Jun Sasaki, Hazuki Takahashi, Yuji Furutani, Hideki Kandori, John L. Spudich

Biophysical Journal   100 ( 9 )   2178 - 2183   2011年05月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Cell Press  

DOI： 10.1016/j.bpj.2011.03.026

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006349511003742

Chimeric microbial rhodopsins containing the third cytoplasmic loop of bovine rhodopsin 査読あり 国際誌

Aya Nakatsuma, Takahiro Yamashita, Kengo Sasaki, Akira Kawanabe, Keiichi Inoue, Yuji Furutani, Yoshinori Shichida, Hideki Kandori

Biophysical Journal   100 ( 8 )   1874 - 1882   2011年04月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Cell Press  

DOI： 10.1016/j.bpj.2011.02.054

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006349511003079

Sodium or lithium ion-binding-induced structural changes in the K-ring of V-ATPase from enterococcus hirae revealed by ATR-FTIR spectroscopy 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Takeshi Murata, Hideki Kandori

Journal of the American Chemical Society   133 ( 9 )   2860 - 2863   2011年02月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/ja1116414

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ja1116414

FTIR study of the photoreaction of bovine rhodopsin in the presence of hydroxylamine 査読あり 国際誌

Kota Katayama, Yuji Furutani, Hideki Kandori

The Journal of Physical Chemistry B   114 ( 27 )   9039 - 9046   2010年06月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/jp102288c

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jp102288c

Molecular insight into intrinsic heme distortion in ligand binding in hemoprotein. 査読あり 国際誌

Saburo Neya, Masaaki Suzuki, Tyuji Hoshino, Hirotaka Ode, Kiyohiro Imai, Teruyuki Komatsu, Akira Ikezaki, Mikio Nakamura, Yuji Furutani, Hideki Kandori

Biochemistry   49 ( 27 )   5642 - 5650   2010年06月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi1003553

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi1003553

Protein fluctuations as the possible origin of the thermal activation of rod photoreceptors in the dark 査読あり 国際誌

Victor A. Lorenz-Fonfria, Yuji Furutani, Toru Ota, Kazutomo Ido, Hideki Kandori

Journal of the American Chemical Society   132 ( 16 )   5693 - 5703   2010年03月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/ja907756e

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ja907756e

Low-temperature FTIR study of gloeobacter rhodopsin: Presence of strongly hydrogen-bonded water and long-range structural protein perturbation upon retinal photoisomerization 査読あり 国際誌

Kyohei Hashimoto, Ah Reum Choi, Yuji Furutani, Kwang-Hwan Jung, Hideki Kandori

Biochemistry   49 ( 15 )   3343 - 3350   2010年03月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi100184k

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi100184k

An FTIR study of monkey green- And red-sensitive visual pigments 査読あり 国際誌

Kota Katayama, Yuji Furutani, Hiroo Imai, Hideki Kandori

Angewandte Chemie - International Edition   49 ( 5 )   891 - 894   2010年01月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：WILEY-VCH  

DOI： 10.1002/anie.200903837

PubMed

その他リンク： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/anie.200903837

Interaction between Na⁺ ion and carboxylates of the PomA-PomB stator unit studied by ATR-FTIR spectroscopy 査読あり 国際誌

Yuki Sudo, Yuya Kitade, Yuji Furutani, Masaru Kojima, Seiji Kojima, Michio Homma, Hideki Kandori

Biochemistry   48 ( 49 )   11699 - 11705   2009年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi901517n

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi901517n

Engineering an inward proton transport from a bacterial sensor rhodopsin 査読あり 国際共著 国際誌

Akira Kawanabe, Yuji Furutani, Kwang-Hwan Jung, Hideki Kandori

Journal of the American Chemical Society   131 ( 45 )   16439 - 16444   2009年10月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/ja904855g

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ja904855g

Characterization of a signaling complex composed of sensory rhodopsin I and its cognate transducer protein from the eubacterium Salinibacter ruber 査読あり 国際誌

Yuki Sudo, Akiko Okada, Daisuke Suzuki, Keiichi Inoue, Hiroki Irieda, Makoto Sakai, Masaaki Fujii, Yuji Furutani, Hideki Kandori, Michio Homma

Biochemistry   48 ( 42 )   10136 - 10145   2009年09月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi901338d

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi901338d

Effects of Chloride Ion Binding on the Photochemical Properties of Salinibacter Sensory Rhodopsin I 査読あり 国際誌

Daisuke Suzuki, Yuji Furutani, Keiichi Inoue, Takashi Kikukawa, Makoto Sakai, Masaaki Fujii, Hideki Kandori, Michio Homma, Yuki Sudo

Journal of Molecular Biology   392 ( 1 )   48 - 62   2009年09月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Academic Press Ltd. Elsevier Science Ltd.  

DOI： 10.1016/j.jmb.2009.06.050

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0022283609007724

Manipulation of protein-complex function by using an engineered heterotrimeric coiled-coil switch 査読あり 国際誌

Toshihisa Mizuno, Kumiko Suzuki, Tatsuya Imai, Yuya Kitade, Yuji Furutani, Motonori Kudou, Masayuki Oda, Hideki Kandori, Kouhei Tsumoto, Toshiki Tanaka

Organic and Biomolecular Chemistry   7 ( 15 )   3102 - 3111   2009年06月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Royal Societry of Chemistry  

DOI： 10.1039/b901118h

その他リンク： https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2009/ob/b901118h

In situ spectroscopic, electrochemical, and theoretical studies of the photoinduced host-guest electron transfer that precedes unusual host-mediated alkane photooxidation 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Hideki Kandori, Masaki Kawano, Koji Nakabayashi, Michito Yoshizawa, Makoto Fujita

Journal of the American Chemical Society   131 ( 13 )   4764 - 4768   2009年03月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/ja8089075

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ja8089075

Proton release group of pharaonis phoborhodopsin revealed by ATR-FTIR spectroscopy 査読あり 国際誌

Yuya Kitade, Yuji Furutani, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   48 ( 7 )   1595 - 1603   2009年01月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi801984u

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi801984u

A photochromic photoreceptor from a eubacterium. 査読あり 国際誌

Daisuke Suzuki, Tomomi Kitajima-Ihara, Yuji Furutani, Kunio Ihara, Hideki Kandori, Michio Homma, Yuki Sudo

Communicative & integrative biology   1 ( 2 )   150 - 152   2008年12月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Taylor & Francis  

DOI： 10.4161/cib.1.2.7000

PubMed

その他リンク： https://www.tandfonline.com/doi/full/10.4161/cib.1.2.7000

Structural changes of Salinibacter sensory rhodopsin I upon formation of the K and M photointermediates 査読あり 国際誌

Daisuke Suzuki, Yuki Sudo, Yuji Furutani, Hazuki Takahashi, Michio Homma, Hideki Kandori

Biochemistry   47 ( 48 )   12750 - 12759   2008年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi801358b

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi801358b

Functional evaluation of iron oxypyriporphyrin in protein heme pocket 査読あり 国際誌

Saburo Neya, Masaaki Suzuki, Hirotaka Ode, Tyuji Hoshino, Yuji Furutani, Hideki Kandori, Hiroshi Hori, Kiyohiro Imai, Teruyuki Komatsu

Inorganic Chemistry   47 ( 22 )   10771 - 10778   2008年10月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/ic801406x

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ic801406x

FTIR study of the L intermediate of Anabaena sensory rhodopsin: Structural changes in the cytoplasmic region 査読あり 国際共著 国際誌

Akira Kawanabe, Yuji Furutani, Sa Ryong Yoon, Kwang-Hwan Jung, Hideki Kandori

Biochemistry   47 ( 38 )   10033 - 10040   2008年08月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi800941a

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi800941a

Salinibacter sensory rhodopsin: Sensory rhodopsin I-like protein from a eubacterium 査読あり 国際誌

Tomomi Kitajima-Ihara, Yuji Furutani, Daisuke Suzuki, Kunio Ihara, Hideki Kandori, Michio Homma, Yuki Sudo

Journal of Biological Chemistry   283 ( 35 )   23533 - 23541   2008年08月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (ASBMB)  

DOI： 10.1074/jbc.M802990200

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925819492648

Protein-protein interaction of a pharaonis halorhodopsin mutant forming a complex with pharaonis halobacterial transducer protein ii detected by fourier-transform infrared spectroscopy 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Motohiro Ito, Yuki Sudo, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Photochemistry and Photobiology   84 ( 4 )   874 - 879   2008年07月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：WILEY-VCH  

DOI： 10.1111/j.1751-1097.2008.00317.x

PubMed

その他リンク： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1751-1097.2008.00317.x

Steric constraint in the primary photoproduct of sensory rhodopsin II is a prerequisite for light-signal transfer to HtrII 査読あり 国際誌

Motohiro Ito, Yuki Sudo, Yuji Furutani, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Michio Homma, John L. Spudich, Hideki Kandori

Biochemistry   47 ( 23 )   6208 - 6215   2008年05月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi8003507

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi8003507

Color change of proteorhodopsin by a single amino acid replacement at a distant cytoplasmic loop 査読あり 国際誌

Maiko Yoshitsugu, Mikihiro Shibata, Daisuke Ikeda, Yuji Furutani, Hideki Kandori

Angewandte Chemie - International Edition   47 ( 21 )   3923 - 3926   2008年05月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：WILEY-VCH  

DOI： 10.1002/anie.200705989

PubMed

その他リンク： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/anie.200705989

Active internal waters in the bacteriorhodopsin photocycle. A comparative study of the L and M intermediates at room and cryogenic temperatures by infrared spectroscopy 査読あり 国際誌

Victor A. Lorenz-Fonfria, Yuji Furutani, Hideki Kandori

Biochemistry   47 ( 13 )   4071 - 4081   2008年03月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi7024063

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi7024063

Quantum yields for the light adaptations in Anabaena sensory rhodopsin and bacteriorhodopsin 査読あり 国際誌

Yoichiro Wada, Akira Kawanabe, Yuji Furutani, Hideki Kandori, Hiroyuki Ohtani

Chemical Physics Letters   453 ( 1-3 )   105 - 108   2008年02月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier B.V.  

DOI： 10.1016/j.cplett.2008.01.010

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0009261408000407

Structural changes in the O-decay accelerated mutants of pharaonis phoborhodopsin 査読あり 国際誌

Yuki Sudo, Yuji Furutani, Masayuki Iwamoto, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   47 ( 9 )   2866 - 2874   2008年02月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi701885k

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi701885k

Structural changes of sensory rhodopsin I and its transducer protein are dependent on the protonated state of Asp76 査読あり 国際共著 国際誌

Yuji Furutani, Hazuki Takahashi, Jun Sasaki, Yuki Sudo, John L. Spudich, Hideki Kandori

Biochemistry   47 ( 9 )   2875 - 2883   2008年01月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi702050c

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi702050c

Electronic properties in a five-coordinate azido complex of nonplanar iron(III) porphyrin: Revisiting to quantum mechanical spin admixing 査読あり 国際誌

Saburo Neya, Akihiro Takahashi, Hirotaka Ode, Tyuji Hoshino, Akira Ikezaki, Yoshiki Ohgo, Masashi Takahashi, Yuji Furutani, Victor A. Lorenz-Fonfria, Hideki Kandori, Hirotsugu Hiramatsu, Teizo Kitagawa, Junji Teraoka, Noriaki Funasaki, Mikio Nakamura

Bulletin of the Chemical Society of Japan   81 ( 1 )   136 - 141   2008年01月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：The Chemical Society of Japan  

DOI： 10.1246/bcsj.81.136

その他リンク： https://www.journal.csj.jp/doi/10.1246/bcsj.81.136

Clay mimics color tuning in visual pigments 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Kazutomo Ido, Masako Sasaki, Makoto Ogawa, Hideki Kandori

Angewandte Chemie - International Edition   46 ( 42 )   8010 - 8012   2007年10月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：WILEY-VCH  

DOI： 10.1002/anie.200702368

PubMed

その他リンク： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.200702368

Magnetic and infrared properties of the azide complex of (2,7,12,17-tetrapropylporphycenato)iron(III): A novel admixing mechanism of the S = 5/2 and S = 3/2 states 査読あり 国際誌

Saburo Neya, Akihiro Takahashi, Hirotaka Ode, Tyuji Hoshino, Masayuki Hata, Akira Ikezaki, Yoshiki Ohgo, Masashi Takahashi, Hirotsugu Hiramatsu, Teizo Kitagawa, Yuji Furutani, Hideki Kandori, Noriaki Funasaki, Mikio Nakamura

European Journal of Inorganic Chemistry   ( 20 )   3188 - 3194   2007年07月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：WILEY-VCH  

DOI： 10.1002/ejic.200601183

その他リンク： https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ejic.200601183

Photochromism of Anabaena sensory rhodopsin 査読あり 国際誌

Akira Kawanabe, Yuji Furutani, Kwang-Hwan Jung, Hideki Kandori

Journal of the American Chemical Society   129 ( 27 )   8644 - 8649   2007年06月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/ja072085a

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ja072085a

Early photocycle structural changes in a bacteriorhodopsin mutant engineered to transmit photosensory signals 査読あり 国際共著 国際誌

Yuki Sudo, Yuji Furutani, John L. Spudich, Hideki Kandori

Journal of Biological Chemistry   282 ( 21 )   15550 - 15558   2007年05月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (ASBMB)  

DOI： 10.1074/jbc.M701271200

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925820874304

FTIR study of the retinal Schiff base and internal water molecules of proteorhodopsin 査読あり 国際誌

Daisuke Ikeda, Yuji Furutani, Hideki Kandori

Biochemistry   46 ( 18 )   5365 - 5373   2007年04月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi700143g

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi700143g

Conformational coupling between the cytoplasmic carboxylic acid and the retinal in a fungal light-driven proton pump 査読あり 国際共著 国際誌

Yuji Furutani, Masayo Sumii, Ying Fan, Lichi Shi, Stephen A. Waschuk, Leonid S. Brown, Hideki Kandori

Biochemistry   45 ( 51 )   15349 - 15358   2006年12月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi061864l

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi061864l

Functional importance of the interhelical hydrogen bond between Thr 204 and Tyr174 of sensory rhodopsin II and its alteration during the signaling process 査読あり 国際共著 国際誌

Yuki Sudo, Yuji Furutani, Hideki Kandori, John L. Spudich

Journal of Biological Chemistry   281 ( 45 )   34239 - 34245   2006年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (ASBMB)  

DOI： 10.1074/jbc.M605907200

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925820706083

Assignment of the hydrogen-out-of-plane and -in-plane vibrations of the retinal chromophore in the K intermediate of pharaonis phoborhodopsin 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Yuki Sudo, Akimori Wada, Masayoshi Ito, Kazumi Shimono, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   45 ( 39 )   11836 - 11843   2006年09月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi0610597

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi0610597

Strongly hydrogen-bonded water molecule is observed only in the alkaline form of proteorhodopsin 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Daisuke Ikeda, Mikihiro Shibata, Hideki Kandori

Chemical Physics   324 ( 2-3 )   705 - 708   2006年05月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier B.V.  

DOI： 10.1016/j.chemphys.2005.12.013

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0301010405006592

Temperature-dependent interactions between photoactivated Pharaonis phoborhodopsin and its transducer 査読あり 国際誌

Kentaro Kamada, Yuji Furutani, Yuki Sudo, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   45 ( 15 )   4859 - 4866   2006年03月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi060047i

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi060047i

FTIR study of the photoisomerization processes in the 13-cis and all-trans forms of Anabaena sensory rhodopsin at 77 K 査読あり 国際共著 国際誌

Akira Kawanabe, Yuji Furutani, Kwang-Hwan Jung, Hideki Kandori

Biochemistry   45 ( 14 )   4362 - 4370   2006年03月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi052324b

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi052324b

Structural changes in the Schiff base region of squid rhodopsin upon photoisomerization studied by low-temperature FTIR spectroscopy 査読あり 国際誌

Toru Ota, Yuji Furutani, Akihisa Terakita, Yoshinori Shichida, Hideki Kandori

Biochemistry   45 ( 9 )   2845 - 2851   2006年02月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi051937l

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi051937l

Steric constraint in the primary photoproduct of an archaeal rhodopsin from regiospecific perturbation of C-D stretching vibration of the retinyl chromophore 査読あり 国際誌

Yuki Sudo, Yuji Furutani, Akimori Wada, Masayoshi Ito, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Journal of the American Chemical Society   127 ( 46 )   16036 - 16037   2005年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/ja056203a

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ja056203a

Strongly hydrogen-bonded water molecule present near the retinal chromophore of Leptosphaeria rhodopsin, the bacteriorhodopsin-like proton pump from a eukaryote 査読あり 国際共著 国際誌

Masayo Sumii, Yuji Furutani, Stephen A. Waschuk, Leonid S. Brown, Hideki Kandori

Biochemistry   44 ( 46 )   15159 - 15166   2005年10月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi0513498

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi0513498

FTIR spectroscopy of the all-trans form of Anabaena sensory rhodopsin at 77 K: Hydrogen bond of a water between the Schiff base and Asp75 査読あり 国際共著 国際誌

Yuji Furutani, Akira Kawanabe, Kwang-Hwan Jung, Hideki Kandori

Biochemistry   44 ( 37 )   12287 - 12296   2005年08月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi050841o

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi050841o

FTIR studies of the photoactivation processes in squid retinochrome 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Akihisa Terakita, Yoshinori Shichida, Hideki Kandori

Biochemistry   44 ( 22 )   7988 - 7997   2005年05月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi050219w

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi050219w

Structural changes of the complex between pharaonis phoborhodopsin and its cognate transducer upon formation of the M photointermediate 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Kentaro Kamada, Yuki Sudo, Kazumi Shimono, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   44 ( 8 )   2909 - 2915   2005年02月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi047893i

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi047893i

FTIR spectroscopy of the K photointermediate of Neurospora rhodopsin: Structural changes of the retinal, protein, and water molecules after photoisomerization 査読あり 国際共著 国際誌

Yuji Furutani, Arandi G. Bezerra, Stephen Waschuk, Masayo Sumii, Leonid S. Brown, Hideki Kandori

Biochemistry   43 ( 30 )   9636 - 9646   2004年07月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi049158c

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi049158c

FTIR Spectroscopy of the O Photointermediate in pharaonis Phoborhodopsin 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Masayuki Iwamoto, Kazumi Shimono, Akimori Wada, Masayoshi Ito, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   43 ( 18 )   5204 - 5212   2004年04月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi036316b

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi036316b

赤外分光法による脊椎動物および古細菌ロドプシンの光情報伝達機構に関する研究

古谷 祐詞

2004年03月

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記述言語：日本語   掲載種別：学位論文（博士）  

その他リンク： https://repository.kulib.kyoto-u.ac.jp/dspace/handle/2433/147879

Hydrogen Bonding Alteration of Thr-204 in the Complex between pharaonis Phoborhodopsin and Its Transducer Protein 査読あり 国際誌

Yuki Sudo, Yuji Furutani, Kazumi Shimono, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   42 ( 48 )   14166 - 14172   2003年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi035678g

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi035678g

Structural changes of water molecules during the photoactivation processes in bovine rhodopsin 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Yoshinori Shichida, Hideki Kandori

Biochemistry   42 ( 32 )   9619 - 9625   2003年07月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi034592k

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi034592k

Structural changes in lumirhodopsin and metarhodopsin I studied by their photoreactions at 77 K 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Hideki Kandori, Yoshinori Shichida

Biochemistry   42 ( 28 )   8494 - 8500   2003年06月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi034438y

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi034438y

Vibrational modes of the protonated Schiff base in pharaonis phoborhodopsin 査読あり 国際誌

Kazumi Shimono, Yuji Furutani, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   42 ( 25 )   7801 - 7806   2003年05月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi034284m

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi034284m

FTIR spectroscopy of the complex between pharaonis phoborhodopsin and its transducer protein 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Yuki Sudo, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   42 ( 17 )   4837 - 4842   2003年04月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi034317y

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi034317y

Proton transfer reactions in the F86D and F86E mutants of pharaonis phoborhodopsin (sensory rhodopsin II) 査読あり 国際誌

Masayuki Iwamoto, Yuji Furutani, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biochemistry   42 ( 10 )   2790 - 2796   2003年02月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi0270283

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi0270283

Structural changes of water in the Schiff base region of bacteriorhodopsin: Proposal of a hydration switch model 査読あり 国際誌

Taro Tanimoto, Yuji Furutani, Hideki Kandori

Biochemistry   42 ( 8 )   2300 - 2306   2003年02月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi026990d

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi026990d

FTIR spectroscopy of the M photointermediate in pharaonis phoborhodopsin 査読あり 国際誌

Yuji Furutani, Masayuki Iwamoto, Kazumi Shimono, Naoki Kamo, Hideki Kandori

Biophysical Journal   83 ( 6 )   3482 - 3489   2002年12月

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担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Cell Press  

DOI： 10.1016/S0006-3495(02)75347-2

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006349502753472

Role of Asp193 in chromophore-protein interaction of pharaonis phoborhodopsin (sensory rhodopsin II) 査読あり 国際誌

Masayuki Iwamoto, Yuji Furutani, Yuki Sudo, Kazumi Shimono, Hideki Kandori, Naoki Kamo

Biophysical Journal   83 ( 2 )   1130 - 1135   2002年08月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Cell Press  

DOI： 10.1016/S0006-3495(02)75236-3

PubMed

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006349502752363

A pharaonis phoborhodopsin mutant with the same retinal binding site residues as in bacteriorhodopsin 査読あり 国際誌

Kazumi Shimono, Yuji Furutani, Hideki Kandori, Naoki Kamo

Biochemistry   41 ( 20 )   6504 - 6509   2002年04月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi025636c

PubMed

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi025636c

Internal water molecules of pharaonis phoborhodopsin studied by low-temperature infrared spectroscopy 査読あり 国際誌

Hideki Kandori, Yuji Furutani, Kazumi Shimono, Yoshinori Shichida, Naoki Kamo

Biochemistry   40 ( 51 )   15693 - 15698   2001年11月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society  

DOI： 10.1021/bi011621n

その他リンク： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/bi011621n

Excited-state dynamics of rhodopsin probed by femtosecond fluorescence spectroscopy 査読あり 国際誌

Hideki Kandori, Yuji Furutani, Shoko Nishimura, Yoshinori Shichida, Haik Chosrowjan, Yutaka Shibata, Noboru Mataga

Chemical Physics Letters   334 ( 4-6 )   271 - 276   2001年02月

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier B.V.  

DOI： 10.1016/S0009-2614(00)01457-3

その他リンク： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0009261400014573