片山 耕大 (カタヤマ コウタ)

KATAYAMA Kota

写真a

所属学科・専攻等

生命・応用化学科 生命・物質化学分野
工学専攻 生命・物質化学プログラム
若手研究イノベータ養成センター

職名

准教授

外部リンク

学位

  • 博士 (工学) ( 2013年09月   名古屋工業大学 )

研究分野

  • ライフサイエンス / 生物物理学

学外略歴

  • Case Western Reserve University   日本学術振興会特別研究員

    2014年01月 - 2016年12月

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    国名:アメリカ合衆国

所属学協会

  • 生物物理学会

  • 分子科学会

 

研究経歴

  • ヒト色覚視物質のX線結晶構造解析

    科学研究費補助金  

    研究期間: 2015年04月 - 2016年12月

  • 霊長類色覚視物質の赤外分光研究

    科学研究費補助金  

    研究期間: 2011年04月 - 2014年12月

論文

  • Structural basis for the allosteric modulation of rhodopsin by nanobody binding to its extracellular domain 査読あり 国際共著

    A. Wu, D. Salom, J. D. Hong, A. Tworak, K. Watanabe, E. Pardon, J. Steyaert, H. Kandori, K. Katayama*, P. D. Kiser*, K. Palczewski*

    Nat. Commun   14 ( 1 )   5209   2023年09月

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    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-023-40911-9

  • Structural basis for ion selectivity in potassium-selective channelrhodopsins 査読あり 国際共著

    S. Tajima, Y. S. Kim, M. Fukuda, Y. Jo, P. Y. Wang, J. M. Paggi, M. Inoue, E. F. X. Byrne, K. E. Kishi, S. Nakamura, C. Ramakrishnan, S. Takaramoto, T. Nagata, M. Konno, M. Sugiura, K. Katayama, T. E. Matsui, K. Yamashita, S. Kim, H. Ikeda, J. Kim, H. Kandori, R. O. Dror, K. Inoue, K. Deisseroth*, H. E. Kato*

    Cell   186 ( 20 )   4325 - 4344   2023年09月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.cell.2023.08.009

  • Investigating the Mechanism of Photoisomerization in Jellyfish Rhodopsin with the Counterion at an Atypical Position 査読あり

    S. Inukai, K. Katayama*, M Koyanagi, A. Terakita, H. Kandori*

    Journal of Biological Chemistry   299 ( 6 )   104726   2023年05月

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    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.jbc.2023.104726

  • Phototrophy by antenna-containing rhodopsin pumps in aquatic environments 査読あり 国際共著

    A. Chazan, I. Das, T. Fujiwara, S. Murakoshi, A. Rozenberg, A. Molina-Márquez, F. K. Sano, T. Tanaka, P. Gómez-Villegas, S. Larom, A. Pushkarev, P. Malakar, M. Hasegawa, Y. Tsukamoto, T. Ishizuka, M. Konno, T. Nagata, Y. Mizuno, K. Katayama, R, Abe-Yoshizumi, S. Ruhman, K. Inoue, H. Kandori, R. León, W. Shihoya*, S. Yoshizawa*, M. Sheves*, O. Nureki*, O. Béjà*

    Nature   2023年03月

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    記述言語:英語  

    DOI: 10.1038/s41586-023-05774-6

  • Early proton transfer reaction in a primate blue-sensitive visual pigment 査読あり

    Yosuke Mizuno, Kota Katayama, Hiroo Imai, Hideki Kandori

    Biochemistry   2022年11月

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    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Rhodopsin-bestrophin fusion proteins from unicellular algae form gigantic pentameric ion channels 査読あり 国際共著

    28. Andrey Rozenberg, Igor Kaczmarczyk, Donna Matzov, Johannes Vierock, Takashi Nagata, Masahiro Sugiura, Kota Katayama, Yuma Kawasaki, Masae Konno, Yujiro Nagasaka, Mako Aoyama, Ishita Das, Efrat Pahima, Jonathan Church, Suliman Adam, Veniamin A. Borin, Ariel Chazan, Sandra Augustin, Jonas Wietek, Julien Dine, Yoav Peleg, Akira Kawanabe, Yuichiro Fujiwara, Ofer Yizhar, Mordechai Sheves, Igor Schapiro, Yuji Furutani, Hideki Kandori, Keiichi Inoue, Peter Hegemann, Oded Béjà, Moran Shalev-Benami

    Nat. Struct. Mol. Biol.   29   592 - 603   2022年06月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: https://doi.org/10.1038/s41594-022-00783-x

  • Unique hydrogen-bonding network in a viral channelrhodopsin 査読あり

    M. Aoyama, K. Katayama, H. Kandori*

    Biochim. Biophys. Acta. Bioenerg.   1865 ( 4 )   149148   2024年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2024.149148

  • The high-light-sensitivity mechanism and optogenetic properties of the bacteriorhodopsin-like channelrhodopsin GtCCR4 査読あり

    T. Tanaka, S. Hososhima, Y. Yamashita, T. Sugimoto, T. Nakamura, S. Shigemura, W. Iida, F. K. Sano, K. Oda, T. Uchihashi, K. Katayama, Y. Furutani, S. P. Tsunoda, W. Shihoya, H. Kandori*, O. Nureki*

    Mol. Cell   84 ( 18 )   3530 - 3544   2024年09月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: https://doi.org/10.1016/j.molcel.2024.08.016

  • FTIR study of light-induced proton transfer and Ca2+ binding in T82D mutant of TAT rhodopsin 査読あり

    T. Sugimoto, K. Katayama, H. Kandori*

    Biophys. J   2024年08月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2024.08.005

  • Calcium binding mechanism in TAT rhodopsin 査読あり

    T. Sugimoto, K. Miyagawa M. Shoji*, K. Katayama, Y. Shigeta, H. Kandori*

    J. Phys. Chem. B.   128 ( 29 )   7102 - 7111   2024年07月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c02363

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書籍等出版物

  • Phototransduction: Rhodopsin and Cone pigments 査読あり

    K. Katayama( 担当: 単著)

    Encyclopedia of the Eye, 2nd edition 

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    記述言語:英語   著書種別:学術書

  • Color tuning in retinylidene proteins

    K. Katayama, S. Sekharan, Y. Sudo*( 担当: 共著)

    Optogenetics  2015年 

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    担当ページ:89-108   記述言語:英語   著書種別:学術書

MISC

  • 量子効果を巧みに操る色覚センサータンパク質の構造解析 招待あり 査読あり

    片山耕大

    「量子生命科学ハンドブック」(仮題) 株式会社エヌ・ティー・エス   2023年

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

  • 赤外分光法を活用し、目の中で光を感じるタンパク質の進化を追う 招待あり 査読あり

    片山耕大

    「光技術コンタクト」誌 11月号 特集テーマ「光と生体の相互作用 (新しい視覚センサー、視機能の向上など」   2023年

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

  • Frontier of Structure-function studies to unveil diverse GPCR signaling 招待あり 査読あり

    K. Katayama, R. Suno

    Biophysical Reviews Special Issue Call: 'Special Issue (SI) on the Biophysical Society of Japan (BSJ) - Miyazaki Meeting, September, 2019', SPRINGER NATURE   2020年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(国際会議プロシーディングズ)  

  • Light-induced difference FTIR spectroscopy of photoreceptive proteins

    H. Kandori, K. Katayama

    Vibrational Spectroscopy in Protein Research: From Purified Proteins to Aggregates and Assemblies (Y. Ozaki, M. Baranska, I. Lednev, B. R. Wood, eds)   2019年

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier  

  • “海外だより ~競争国アメリカでのあくなき挑戦~” 招待あり 査読あり

    片山 耕大

    生物物理, 日本生物物理学会   2015年10月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(その他)  

  • FTIR study of primate color visual pigments 招待あり 査読あり

    K. Katayama, H. Kandori

    Biophysics (Nagoya-shi)   11   61 - 66   2015年

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(その他)  

講演・口頭発表等

  • 未定 国際共著

    板倉彰汰、水野陽介、片山耕大、吉住玲、Gali Tzlil、Ariel Chazan、Oded Béjà、神取秀樹

    日本生体エネルギー研究会 第50回討論会  2024年12月 

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    開催年月日: 2024年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:名古屋市   国名:日本国  

  • 魚類がもつ短波長感受性視物質の解明に向けた赤外分光研究

    新井想空、水野陽介、神取秀樹、片山耕大

    生理学研究所研究会2024「東海地区感覚機能研究会」  2024年12月 

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    開催年月日: 2024年12月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:岡崎市   国名:日本国  

  • 光捕集アンテナとして結合したカロテノイド効果に関する分光解析 国際共著

    板倉彰汰、水野陽介、片山耕大、吉住玲、Gali Tzlil、Ariel Chazan、Oded Béjà、神取秀樹

    第47回日本分子生物学会年会  2024年11月 

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    開催年月日: 2024年11月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:福岡市   国名:日本国  

  • オピオイド受容体に対するナトリウムイオンアロステリック効果の観測

    西川遼、岩田聖矢、寿野良二、池田-寿野千代、小林拓也、片山耕大、神取秀樹

    第47回 日本分子生物学会年会  2024年11月 

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    開催年月日: 2024年11月

    記述言語:日本語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:福岡市   国名:日本国  

  • Photoisomerization and activation mechanisms in box jellyfish rhodopsin with the counterion at an atypical position 招待あり 国際会議

    S. Inukai, M Koyanagi, A. Terakita, H. Kandori, K. Katayama

    Scientific seminar (仮)  2024年11月 

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    開催年月日: 2024年11月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:グレートブリテン・北アイルランド連合王国(英国)  

  • Infrared Spectroscopic Studies Aimed at Elucidating the Photoreaction Dynamics of Visual Pigments 招待あり 国際会議

    Y. Mizuno, H. Imai, H. Kandori, K. Katayama

    未定  2024年11月 

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    開催年月日: 2024年11月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:スイス連邦  

  • 未定 招待あり 国際共著 国際会議

    S. Ohashi, M. Fukuda, A. Kojima, R. Suno, Y. Sugita, N. Nuemket, S. Iwata, E. Nango, T. Koboyashi, T. Noda, H. Kato, H. Kandori, K. Katayama

    未定  2024年11月 

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    開催年月日: 2024年11月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    国名:スイス連邦  

  • How far can structure-spectroscopy studies of cone pigments approach the essence of the spectral tuning mechanism? 招待あり 国際共著 国際会議

    K Katayama

    20th International Conference on Retinal Proteins  2024年11月 

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    開催年月日: 2024年11月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:インターラーケン市スイス連邦   国名:スイス連邦  

  • FTIR study of bistable rhodopsin 国際共著 国際会議

    S. Itakura, Y. Mizuno, O. Berman, M. Benami, K. Katayama, H. Kandori

    20th International Conference on Retinal Proteins  2024年11月 

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    開催年月日: 2024年11月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    国名:スイス連邦  

  • Light-induced FTIR spectroscopy of microcrystals of visual rhodopsin grown in LCP 国際共著 国際会議

    Y. Mizuno, P. Valérie, K. Katayama, G. Schertler, H. Kandori, Y. Furutani

    20th International Conference on Retinal Proteins  2024年11月 

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    開催年月日: 2024年11月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    国名:スイス連邦  

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受賞

  • 令和6年度名古屋工業大学職員特別褒章

    2024年05月   名古屋工業大学   色覚視物質の作動メカニズム解明に向けた構造機能相関研究

    片山耕大

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    受賞国:日本国

  • 令和6年度科学技術分野の文部科学大臣若手科学者賞

    2024年04月   文部科学省   色覚視物質の作動メカニズム解明に向けた構造機能相関研究

    片山耕大

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    受賞国:日本国

  • IUPAB2024 Student and Early Career Researcher Poster Award

    2024年06月   Activation mechanism of light-sensitive Gs protein-coupled receptor, jellyfish rhodopsin

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    受賞区分:国際学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:日本国

  • IUPAB2024 Student and Early Career Researcher Poster Award

    2024年06月   FTIR study of mutants of primate red and green pigments

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    受賞区分:国際学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:日本国

  • IUPAB2024 Student and Early Career Researcher Poster Award

    2024年06月   Structural basis for early proton transfer reaction on a primate blue-sensitive pigment

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    受賞区分:国際学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:日本国

  • IUPAB2024 Student and Early Career Researcher Poster Award

    2024年06月   Carotenoids binding effect of the photoreaction processes on Xanthorhodopsin (Kin4B8)

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    受賞区分:国際学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:日本国

  • 松尾研究奨励賞

    2024年05月   第18回GPCR研究会   ヒトアセチルコリン受容体M2Rの活性化を制御する ホットスポット残基の特定

    片山耕大

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    受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:日本国

  • 第13回 (2020年度) 分子科学会奨励賞

    2020年08月   分子科学会  

    片山耕大

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    受賞国:日本国

  • 第14回わかしゃち奨励賞<基礎研究部門>優秀賞

    2020年01月   愛知県産業科学技術課  

    片山耕大

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    受賞国:日本国

  • 第46回生体分子科学討論会優良ポスター賞

    2019年06月   第46回生体分子科学討論会  

    魲洸平

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    受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:日本国

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科研費(文科省・学振)獲得実績

  • 振動分光法を基軸としたGPCRアロステリックリガンド作用機構解明

    2021年04月 - 2025年03月

    科学研究費補助金  基盤研究(B)

  • 明暗視をもたらす動物ロドプシンの構造ダイナミクスの解明

    2020年04月 - 2022年03月

    科学研究費補助金  新学術領域研究

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    担当区分:研究代表者 

  • 青感受性色覚タンパク質の高分解能X線結晶構造解析

    2018年04月 - 2020年03月

    科学研究費補助金  若手研究

  • ヒト色覚視物質のX線結晶構造解析

    2015年04月 - 2016年12月

    科学研究費補助金  特別研究員奨励費

  • 霊長類色覚視物質の赤外分光研究

    2013年10月 - 2014年12月

    科学研究費補助金  特別研究員奨励費

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その他競争的資金獲得実績

  • GPCRの分子認識・結合のからくりを解く

    2023年04月 - 2025年03月

    加藤記念バイオサイエンス振興財団  加藤記念バイオサイエンス振興財団研究助成 

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:2000000円

  • 赤外分光法によるオピオイド受容体の選択的リガンド認識機構に関する研究

    2021年04月 - 2022年03月

    民間財団等  高橋産業経済研究財団研究助成 

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    資金種別:競争的資金

  • 赤外分光法によるオピオイド受容体の選択的リガンド認識機構に関する研究

    2020年04月 - 2021年03月

    民間財団等  高橋産業経済研究財団研究助成 

    片山耕大

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

  • 構造基盤に立脚した色認識機構および色覚情報伝達機構の解明

    2019年10月 - 2023年03月

    文部科学省  戦略的創造研究推進事業 

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    資金種別:競争的資金

  • GPCRの動的構造変化把握のための赤外分光法の利用可能性の検証

    2019年06月 - 2020年03月

    民間財団等  内藤科学技術振興財団研究助成 

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    資金種別:競争的資金

共同研究実施実績

  • 霊長類色覚視物質の高分解能X線結晶構造解析

    2020年04月 - 現在

    政府機関  国内共同研究 

 

担当経験のある授業科目(学外)

  • 量子化学

    2024年10月 - 2025年03月 機関名:名古屋工業大学

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    科目区分:学部専門科目  国名:日本国

  • 量子化学

    2024年04月 - 2024年07月 機関名:名古屋工業大学

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    科目区分:その他  国名:日本国

  • 化学

    2024年04月 - 2024年05月 機関名:名古屋工業大学

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    科目区分:その他  国名:日本国

  • 物質工学演習

    2018年04月 - 2025年03月 機関名:名古屋工業大学

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    科目区分:その他  国名:日本国

  • 実践研究セミナー

    2017年10月 - 現在 機関名:名古屋工業大学

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    科目区分:学部専門科目  国名:日本国

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その他教育活動及び特記事項

  • 令和3年度生命・応用化学科過年度生クラス担任

    2021年04月 - 現在

  • 平成30年度生命・応用化学科1年aクラス

    2018年04月 - 現在

 

委員歴

  • 文部科学省 科学技術・学術政策研究所 科学技術予測センター   専門調査員  

    2024年04月 - 現在   

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    団体区分:政府

  • 生物物理学会   理事  

    2021年06月 - 現在   

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    団体区分:学協会

  • 日本生物物理学会   分野別専門委員  

    2019年04月 - 現在   

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    団体区分:学協会

  • 文部科学省 科学技術・学術政策研究所 科学技術予測センター   専門調査員  

    2019年04月 - 2022年03月   

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    団体区分:政府

メディア報道

  • 「振動分光法を駆使した薬剤効能測定法の開発 ~アセチルコリン受容体を標的とした神経疾患の治療薬開発への期待~」 新聞・雑誌

    日本経済新聞  https://www.nikkei.com/article/DGXLRSP622858_R01C21A2000000/  2021年12月

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    執筆者:本人